网上申请汽车摇号的流程因地区而异。以北京为例，可以通过以下步骤进行：

1. 登录北京市小客车指标调控管理信息系统网站，选择相应的选项并填写个人信息。

2. 等待审核确认，如果注册申请信息通过审核，则激活指标。

3. 在指定时间内登录摇号系统，参与摇号。这个过程可能需要缴纳一定的保证金或定金。具体摇号时间请关注当地小客车指标调控管理机构的公布信息。

请注意，不同地区申请摇号的方式可能有所不同，如需获取具体的申请流程，可以访问当地小客车指标调控管理信息系统的网站查看相关信息，或咨询当地的车管所。另外请注意申请的时间和准备好相关的资料，确保在指定时间内完成申请。